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應(yīng)用(Application)
動物視頻跟蹤和行為分析系統(tǒng)

時間:2022-09-26

作者:易科泰

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簡介:

  動物視頻跟蹤和行為分析系統(tǒng)由高分辨率高幀頻工業(yè)相機(jī)、專業(yè)動物行為采集及分析軟件、紅外背光板等組成,無需標(biāo)記即可對魚類、昆蟲、哺乳動物、鳥類的行為進(jìn)行分析。使用時可直接使用軟件錄制高質(zhì)量的動物活動視頻并對視頻中的目標(biāo)動物進(jìn)行識別跟蹤,獲得目標(biāo)動物的位置坐標(biāo)(X坐標(biāo)和Y坐標(biāo);單個動物可做3D跟蹤,即包括XYZ坐標(biāo))及隨時間變化的活動軌跡。系統(tǒng)可自動計(jì)算個體、處理組、感興趣區(qū)域相關(guān)的20余種行為參數(shù),并可導(dǎo)出疊加分析數(shù)據(jù)的圖像和視頻以便于使用者進(jìn)行展示。

功能特點(diǎn)

  • 采用工業(yè)相機(jī),高分辨率、高幀頻、超高速傳輸
  • 可跟蹤和分析魚類、昆蟲、哺乳動物、鳥類及更多
  • 基于對比度或者背景減除法發(fā)現(xiàn)目標(biāo),無需標(biāo)記物
  • 可跟蹤任意大小和形狀的區(qū)域,如迷宮、水箱、呼吸室
  • 對24孔板、48孔板、96孔板進(jìn)行高通量跟蹤和分析
  • 3D跟蹤,可導(dǎo)出3D坐標(biāo)和路徑
  • 可結(jié)合游泳儀、植入式動物體溫心率數(shù)據(jù)采集器等設(shè)備使用

系統(tǒng)配置

  • 1彩色工業(yè)攝像機(jī)
  • 專業(yè)級定焦鏡頭
  • 專業(yè)動物行為采集及分析軟件LoliTrack5
  • 紅外背光板:用于透明多孔板和透明魚缸等的底部照明,可消除反射,也可用于黑暗環(huán)境的視頻記錄
  • 動物活動室/池(選配):定制化水箱/魚缸、活動室等

技術(shù)指標(biāo)

  • 可自動計(jì)算參數(shù)包括:
  • 位置坐標(biāo)(包括前、后、中線中心、重心)
  • 移動距離
  • 速度和速率(X方向、Y方向)
  • 加速度(X方向、Y方向)
  • 移動方向
  • 身體取向
  • 身體彎曲
  • 轉(zhuǎn)彎速率
  • 移動方向和身體取向變化速率
  • 活動/非活動時間和比例
  • 感興趣區(qū)域花費(fèi)時間和占比
  • 目標(biāo)動物到感興趣區(qū)域的距離
  • 個體間距離(IID),包括平均、眾數(shù)和最小
  • 動物行為觀測分析軟件具備多種基于反差法和背景減除法的過濾功能。
  • 軟件可跟蹤單個區(qū)域或多個區(qū)域內(nèi)的多個動物,即使動物具有相同(或不同)的形狀、顏色和大小。
  • 可挑選單個個體用以跟蹤和分析,而非所有的個體;可自定義跟蹤時長,忽略或者只跟蹤某段時間;具備批量分析功能。
  • 軟件可識別特定身體的點(diǎn)位(如尾、頭、中線中點(diǎn)、重心),跟蹤這些點(diǎn)用以研究運(yùn)動學(xué)(如擺尾頻率、身體擺動等)或者特定的行為(如身體取向、移動方向等)。

  • 軟件具備頻率(心率、擺尾頻率等)計(jì)算和容積(心博量等)計(jì)算功能。

  • 軟件具備錯誤自查功能,并提供手動糾錯的快捷方式。
  • 軟件兼容大部分相機(jī)和視頻格式,具備視頻記錄和編輯工具,具備位置、速度、加速度和轉(zhuǎn)彎速率的熱圖生成功能,并可輸出疊加了分析結(jié)果的視頻和圖片,用戶可自定義Excel數(shù)據(jù)文件輸出內(nèi)容。
  • 軟件能夠?qū)蓚€相機(jī)或者兩個視頻文件的目標(biāo)動物進(jìn)行3D視頻跟蹤和行為分析,導(dǎo)出3D坐標(biāo)和軌跡的3D模型,在其他軟件做進(jìn)一步的可視化和分析。
  • 系統(tǒng)可對24、48或96孔板中的生物進(jìn)行跟蹤和分析,對其活動水平或者運(yùn)動進(jìn)行快速篩選評估(常見于毒理學(xué)或者生物醫(yī)學(xué)檢測)??奢斎胗脩糇远x的處理描述以幫助分析數(shù)據(jù)。

  • 1彩色高清高幀頻工業(yè)攝像機(jī):緊湊設(shè)計(jì),分辨率2592 x 1944 (5.04 MP),幀率48FPS,芯片尺寸1/2.5" (5.702 mm x 4.277 mm),重量33g。包括USB數(shù)據(jù)線、三腳架適配器、壁掛式支架安裝。
  • 專業(yè)級定焦鏡頭:6mm、8mm、12mm、16mm、25mm、50mm焦距可選。

  • 紅外背光板:大小16×16cm至56cm×56cm共6種尺寸可選,波長850nm。

應(yīng)用案例

高濃度人體可卡因代謝物苯甲酰愛康寧(BE)暴露使大型溞個體的活動性顯著降低、游泳速率顯著增大 (Environmental Pollution, 2018)

漸凍癥斑馬魚模型表現(xiàn)出病癥早期階段異常行為增多、晚期階段運(yùn)動活性降低的表型(Glia, 2019)

 

產(chǎn)地:歐洲

 

參考文獻(xiàn)

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