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易科泰(EcoTech)
模塊式藻類表型成像分析系統(tǒng)

時間:2020-02-17

作者:易科泰

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簡介:

 

模塊式藻類表型成像分析系統(tǒng)

 

藻類是藍(lán)藻門、眼蟲藻門、金藻門、甲藻門、綠藻門、褐藻門、紅藻門等一系列水生生物的總稱。其形態(tài)種類眾多,小至微米級的單細(xì)胞微藻,大至長達(dá)幾米乃至幾十米的大型褐藻。藻類作為水體中最重要的初級生產(chǎn)者,對整個生態(tài)系統(tǒng)乃至地球圈的穩(wěn)定都起著極為重要的作用。同時,很多經(jīng)濟(jì)藻類也在食品、醫(yī)藥、能源等行業(yè)中扮演重要角色。而水華、赤潮等有害生態(tài)現(xiàn)象也是由藻類造成的。

 

 

在藻類研究中,需要全面分析藻類的表型特征,尤其是光合生理、形態(tài)、顏色、色素組成與分布、不同色素的光合貢獻(xiàn)、脅迫生理等方面的測量與分析,使藻類表型數(shù)字化、生理生態(tài)及功能可視化。這就需要針對藻類表型專門設(shè)計的表型成像系統(tǒng)方案。

模塊式藻類表型成像分析系統(tǒng)由FMT150藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測單元、FluorCam葉綠素?zé)晒饣蚨喙庾V熒光成像單元、FKM多光譜熒光動態(tài)顯微成像單元、高光譜成像單元(或多光譜成像單元)、RGB彩色成像單元、等組成,是目前市場上配置最靈活、功能最全面、性價比最高、技術(shù)領(lǐng)先的藻類表型與生理生態(tài)研究分析系統(tǒng)。

 

image.png

珊瑚共生體的表型成像研究,左圖:珊瑚收縮-膨脹不同時相NDVI多光譜成像與GFP綠色熒光蛋白成像分析;右圖;珊瑚表面及垂直剖面樣品分別在弱光和強(qiáng)光適應(yīng)條件下的RGB成像、葉綠素?zé)晒獬上窈蚇DVI多光譜成像分析(Leal MC, et al. 2015

 

主要功能特點(diǎn)與技術(shù)指標(biāo):

1.  FMT150藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測技術(shù):將生物反應(yīng)器與監(jiān)測儀器獨(dú)特地結(jié)合在一起,用于淡水、海水藻類和藍(lán)藻等的模塊化精確光照培養(yǎng)與生理監(jiān)測:

1)  image.png尺寸容積可選:400ml、1L、3L等,可定制25L、120L的大型培養(yǎng)容器

2)  全LED光源:紅光、藍(lán)光或白光、紅光雙色光源,其他光質(zhì)可定制,最大光強(qiáng)達(dá)3000μmol (photons).m-2.s-1

3)  精確控制溫度、光強(qiáng)、培養(yǎng)周期、CO2濃度等培養(yǎng)條件,模擬自然周期變化,并可進(jìn)行恒化或恒濁培養(yǎng)

4)  在線實時監(jiān)測溫度、pH值、溶解氧、O2/CO2通量、營養(yǎng)鹽變化、光密度、葉綠素?zé)晒鈪?shù)(反映受脅迫狀況和生理狀態(tài))等多種環(huán)境與生理參數(shù)

5)  通過專用的電腦軟件實現(xiàn)外部控制、數(shù)據(jù)實時在線監(jiān)測和保存

6)  可選配MC1000 8通道藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測單元進(jìn)行快速重復(fù)培養(yǎng)實驗

 

image.png

萊茵衣藻多組學(xué)解析,左圖:使用FMT150進(jìn)行精確控制培養(yǎng);右圖:使用FluorCam進(jìn)行葉綠素?zé)晒夥治觯⊿trenkert, 2019, PNAS)

 

2.  FluorCam葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù):可根據(jù)需求選配不同型號和成像大小的葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng),或選配GFP/YFP等穩(wěn)態(tài)熒光成像、PAR吸收/NDVI成像等:

1)  便攜式葉綠素?zé)晒獬上?,成像面積31.5x41.5mm,可用于野外及實驗室葉綠素?zé)晒獬上穹治觯€可選配光合聯(lián)用系統(tǒng)進(jìn)行光合作用測量和葉綠素?zé)晒獬上穹治鰷y量

2)  封閉式(一體式)葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng),為功能最全(具備全部Protocols包括OJIP、QA再氧化動力學(xué)等)、性價比最高、使用最方便的臺式植物表型成像分析設(shè)備,可同時對植物PAR吸收、光譜反射指數(shù)NDVI等進(jìn)行成像測量

3)  FluorCam模塊式葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng),有13x13cm標(biāo)準(zhǔn)版和20x20大型版,模塊式結(jié)構(gòu),具備可擴(kuò)展性,可選配白色LED光源(用于模擬自然光源)、青色LED光源、綠色LED光源、紅色LED光源、藍(lán)色LED光源等不同激發(fā)光源進(jìn)行光質(zhì)實驗,用于激發(fā)不同的藻類光合色素蛋白(下圖依次為便攜式、一體式、模塊式葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng))

4)  FluorCam大型葉綠素?zé)晒獬上衿脚_,成像面積可達(dá)35x35cm(下圖依次為便攜式、一體式、模塊式葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)和大型葉綠素?zé)晒獬上衿脚_

 

image.png

 

5)  FluorCam多光譜熒光成像技術(shù)方案,配備UV紫外光及專用濾波器激發(fā)并檢測藻類的多光譜熒光,尤其適用于次生代謝組與病害表型研究。有一體式(成像面積13x13cm)或模塊式(成像面積13x13cm或20x20cm)供選配,還可選配實驗室大型多光譜熒光成像平臺

 

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中國海洋大學(xué)使用FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng)研究條斑紫菜Pyropia yezoensis感染赤腐病后的次生代謝響應(yīng)(Tang L, 2019)

 

3.  FKM多光譜熒光動態(tài)顯微成像技術(shù):基于FluorCam葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù)的顯微成像技術(shù)。它由包含可擴(kuò)展部件的增強(qiáng)顯微鏡、高分辨率CCD相機(jī)、激發(fā)光源組、光譜儀、控溫模塊以及相應(yīng)的控制單元和專用的工作站與分析軟件組成。它不僅可以對微藻、單個細(xì)胞、單個葉綠體乃至基粒-基質(zhì)類囊體片段進(jìn)行葉綠素?zé)晒饧岸喙庾V熒光成像分析,還可以進(jìn)行熒光蛋白、熒光染料以及藻類特有光合色素的成像分析。

1)  內(nèi)置現(xiàn)今葉綠素?zé)晒庋芯康娜砍绦?,如Fv/Fm、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng)、熒光淬滅、OJIP快速熒光響應(yīng)曲線、QA再氧化等,可獲得70余項參數(shù)及其成像圖

2)  配備10倍、20倍、40倍、63倍和100倍專用生物熒光物鏡,可以清晰觀測到葉綠體及其發(fā)出的熒光

3)  激發(fā)光源組中包括紅外光、紅光、藍(lán)光、綠光、白光、紫外光和遠(yuǎn)紅光等,能夠研究植物/藻類中任何一種色素分子或發(fā)色團(tuán)

4)  可進(jìn)行GFP、DAPI、DiBAC4、SYTOX、CTC等熒光蛋白、熒光染料的成像分析

5)  高分辨率光譜儀能夠深入解析各種熒光的光譜圖。

6)  控溫系統(tǒng)可以保證實驗樣品在同等溫度條件下進(jìn)行測量,提高實驗精度,也可以進(jìn)行高溫/低溫脅迫研究。

 

image.png

魚腥藻異形胞分化過程中的光合作用規(guī)律(Ferimazova, 2014)

 

4.  image.pngSpecim高光譜成像技術(shù),推薦IQ高光譜成像儀,一體式設(shè)計,內(nèi)置自動推掃、數(shù)據(jù)采集處理、操作系統(tǒng)、觸摸屏及操作鍵、GPS等,機(jī)身小巧輕便,只有1.3kg,實現(xiàn)輕松手持操作或固定操作,波段范圍400-1000nm,7nm光譜分辨率,204個波段,圖像分辨率512x512像素,視野31度,物距15cm至無窮遠(yuǎn),1m視野55x55cm。可選配其它掃描式高光譜成像分析單元(參見下面高光譜成像技術(shù)選型參考表)

 

 

型號

FX10

PFD4k

sCMOS

FX17(nm)

SWIR(nm)

波段范圍

400-1000nm

950-1700

1000-2500

光譜分辨率(FWHM)

5.5nm

3.0nm

2.9nm

8nm

12nm

波段

224

768

946

224

288

空間分辨率(像素)

1024

1775

2184

640

384

光圈

F/1.7

F/2.4

F/2.4

F/1.7

F/2.0

信噪比

600:1

   

1000:1

1050:1

幀頻(fps)

330

100

100

670

450

重量

1.26kg

2.7kg

>2.0kg

1.56kg

>14kg

 

5.  可同時選配RGB成像分析或多光譜成像分析

6.  配置靈活、使用方便,可選配不同單元組合

 

image.png

海洋綠藻、褐藻和紅藻的光譜成像分析(Ginneken V,2017)

 

 

 

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